Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl26F8VQM2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccl26F8VQM2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccl26F8VQM2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccl26F8VQM2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccl26F8VQM2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccl26F8VQM2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccl26F8VQM2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccl26F8VQM2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccl26F8VQM2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms