Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp72F8VQC1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srp72F8VQC1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srp72F8VQC1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms