Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Farp1F8VPU2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Farp1F8VPU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms