Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17654F7AXR3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm17654F7AXR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17654F7AXR3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms