Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Erich3F6QRE9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Erich3F6QRE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Erich3F6QRE9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms