Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29094F6Q785 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm29094F6Q785 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms