Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700024B05RikE9Q6D7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700024B05RikE9Q6D7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1700024B05RikE9Q6D7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700024B05RikE9Q6D7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms