Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc85cE9Q6B2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc85cE9Q6B2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc85cE9Q6B2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms