Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc1E9Q5K9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc1E9Q5K9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms