Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip11E9Q512 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip11E9Q512 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms