Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdr1E9Q0B4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdr1E9Q0B4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms