Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930444G20RikD3Z741 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930444G20RikD3Z741 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms