Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3259D3YUK0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3259D3YUK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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