Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce3B5KM66 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms