Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc11B2RXC1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms