Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700018F24RikB2RW27 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700018F24RikB2RW27 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms