Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clrn2B2RVW2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clrn2B2RVW2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clrn2B2RVW2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clrn2B2RVW2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.7 ms