Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap42B2RQE8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap42B2RQE8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap42B2RQE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap42B2RQE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms