Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik3B1AS29 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grik3B1AS29 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grik3B1AS29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms