Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp36B1AQJ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp36B1AQJ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp36B1AQJ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms