Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttll11A4Q9F4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll11A4Q9F4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll11A4Q9F4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms