Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl41A2AUC9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl41A2AUC9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Klhl41A2AUC9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl41A2AUC9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms