Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn3aA2ASI5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn3aA2ASI5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn3aA2ASI5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms