Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34dA2AGU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34dA2AGU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34dA2AGU5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms