Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gm5938A2AEN9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gm5938A2AEN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5938A2AEN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gm5938A2AEN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gm5938A2AEN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gm5938A2AEN9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Gm5938A2AEN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Gm5938A2AEN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Gm5938A2AEN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Gm5938A2AEN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5938A2AEN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Gm5938A2AEN9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Gm5938A2AEN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Gm5938A2AEN9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5938A2AEN9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms