Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700023F06RikA2AB62 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700023F06RikA2AB62 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700023F06RikA2AB62 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms