Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23■■□□□ 1.27
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