Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms