Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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