Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Crlf3Q9Z2L7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Crlf3Q9Z2L7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Crlf3Q9Z2L7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Crlf3Q9Z2L7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Crlf3Q9Z2L7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Crlf3Q9Z2L7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Crlf3Q9Z2L7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crlf3Q9Z2L7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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