Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms