Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1M8

Ik, Protein Red, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkQ9Z1M8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IkQ9Z1M8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms