Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec2Q9WV35 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec2Q9WV35 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec2Q9WV35 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec2Q9WV35 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec2Q9WV35 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec2Q9WV35 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms