Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms