Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry2Q9R194 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms