Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plod3Q9R0E1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod3Q9R0E1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms