Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a3Q9QZS0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
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