Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf25Q9QZR0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms