Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ripk3Q9QZL0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms