Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms