Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms