Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms