Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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