Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms