Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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