Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms