Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms