Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl39Q9JKF7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl39Q9JKF7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms