Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1fQ9JIS7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms