Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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Rb1cc1Q9ESK9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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